Mit dem Sport verbringt Christian Werner gerne einen Teil seiner Freizeit. Er nimmt immer wieder an diversen Langstreckenläufen teil, um seine Leistungsbereitschaft und seinen Durchhaltewillen zu schulen. So hat er mehrere Male den 100km-Lauf von Biel und den Zürich Marathon bestritten. Daneben übt er regelmässig Krafttraining aus.

Am Zürich Marathon 2007 nach 3 Stunden und 12 Minuten endlich im Ziel.

Bei der zweiten Teilnahme am 100km-Lauf in Biel 2006: Nach langem Kampf
und über 13 Stunden Laufen in Kampfstiefeln erschöpft und glücklich im Ziel.